Protein–RNA interactions for Protein: O75818

RPP40, Ribonuclease P protein subunit p40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPP40O75818 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPP40O75818 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPP40O75818 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPP40O75818 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPP40O75818 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPP40O75818 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPP40O75818 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPP40O75818 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPP40O75818 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPP40O75818 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPP40O75818 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPP40O75818 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPP40O75818 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPP40O75818 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPP40O75818 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPP40O75818 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPP40O75818 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPP40O75818 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RPP40O75818 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPP40O75818 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPP40O75818 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RPP40O75818 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPP40O75818 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPP40O75818 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RPP40O75818 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPP40O75818 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPP40O75818 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPP40O75818 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPP40O75818 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPP40O75818 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPP40O75818 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPP40O75818 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPP40O75818 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPP40O75818 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPP40O75818 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPP40O75818 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPP40O75818 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RPP40O75818 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPP40O75818 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPP40O75818 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPP40O75818 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPP40O75818 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPP40O75818 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPP40O75818 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPP40O75818 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RPP40O75818 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RPP40O75818 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPP40O75818 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPP40O75818 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RPP40O75818 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPP40O75818 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPP40O75818 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPP40O75818 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPP40O75818 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RPP40O75818 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RPP40O75818 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RPP40O75818 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RPP40O75818 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPP40O75818 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPP40O75818 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RPP40O75818 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPP40O75818 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPP40O75818 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPP40O75818 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPP40O75818 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPP40O75818 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPP40O75818 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPP40O75818 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPP40O75818 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPP40O75818 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPP40O75818 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPP40O75818 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RPP40O75818 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RPP40O75818 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPP40O75818 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPP40O75818 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RPP40O75818 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPP40O75818 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPP40O75818 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPP40O75818 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPP40O75818 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPP40O75818 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPP40O75818 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPP40O75818 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPP40O75818 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPP40O75818 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPP40O75818 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPP40O75818 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPP40O75818 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPP40O75818 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPP40O75818 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPP40O75818 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPP40O75818 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPP40O75818 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPP40O75818 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RPP40O75818 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPP40O75818 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPP40O75818 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPP40O75818 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPP40O75818 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms