Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDH16O75309 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDH16O75309 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDH16O75309 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDH16O75309 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDH16O75309 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDH16O75309 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDH16O75309 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDH16O75309 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDH16O75309 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDH16O75309 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDH16O75309 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDH16O75309 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDH16O75309 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDH16O75309 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDH16O75309 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDH16O75309 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDH16O75309 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDH16O75309 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDH16O75309 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDH16O75309 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDH16O75309 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDH16O75309 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDH16O75309 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDH16O75309 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDH16O75309 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDH16O75309 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDH16O75309 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CDH16O75309 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDH16O75309 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDH16O75309 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDH16O75309 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDH16O75309 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDH16O75309 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CDH16O75309 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDH16O75309 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDH16O75309 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDH16O75309 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDH16O75309 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDH16O75309 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDH16O75309 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDH16O75309 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDH16O75309 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDH16O75309 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDH16O75309 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDH16O75309 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDH16O75309 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDH16O75309 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDH16O75309 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDH16O75309 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDH16O75309 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDH16O75309 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDH16O75309 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDH16O75309 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDH16O75309 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CDH16O75309 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDH16O75309 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDH16O75309 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDH16O75309 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDH16O75309 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDH16O75309 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CDH16O75309 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDH16O75309 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDH16O75309 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDH16O75309 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDH16O75309 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDH16O75309 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDH16O75309 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDH16O75309 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDH16O75309 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDH16O75309 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDH16O75309 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDH16O75309 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDH16O75309 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDH16O75309 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDH16O75309 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDH16O75309 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDH16O75309 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDH16O75309 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDH16O75309 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDH16O75309 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDH16O75309 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH16O75309 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH16O75309 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDH16O75309 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDH16O75309 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDH16O75309 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDH16O75309 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDH16O75309 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDH16O75309 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDH16O75309 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDH16O75309 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDH16O75309 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDH16O75309 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CDH16O75309 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDH16O75309 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDH16O75309 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CDH16O75309 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDH16O75309 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDH16O75309 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms