Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACNA1GO43497 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNA1GO43497 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACNA1GO43497 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CACNA1GO43497 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CACNA1GO43497 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNA1GO43497 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACNA1GO43497 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CACNA1GO43497 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA1GO43497 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CACNA1GO43497 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CACNA1GO43497 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA1GO43497 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CACNA1GO43497 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CACNA1GO43497 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA1GO43497 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CACNA1GO43497 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA1GO43497 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CACNA1GO43497 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CACNA1GO43497 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA1GO43497 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CACNA1GO43497 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA1GO43497 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA1GO43497 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA1GO43497 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA1GO43497 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA1GO43497 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA1GO43497 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA1GO43497 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA1GO43497 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA1GO43497 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA1GO43497 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA1GO43497 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNA1GO43497 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNA1GO43497 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNA1GO43497 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNA1GO43497 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA1GO43497 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA1GO43497 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA1GO43497 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNA1GO43497 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA1GO43497 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA1GO43497 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA1GO43497 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA1GO43497 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA1GO43497 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNA1GO43497 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA1GO43497 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNA1GO43497 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA1GO43497 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA1GO43497 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA1GO43497 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA1GO43497 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA1GO43497 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CACNA1GO43497 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CACNA1GO43497 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CACNA1GO43497 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNA1GO43497 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNA1GO43497 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNA1GO43497 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNA1GO43497 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNA1GO43497 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA1GO43497 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA1GO43497 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNA1GO43497 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNA1GO43497 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNA1GO43497 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA1GO43497 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNA1GO43497 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CACNA1GO43497 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA1GO43497 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA1GO43497 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CACNA1GO43497 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1GO43497 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1GO43497 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA1GO43497 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA1GO43497 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA1GO43497 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA1GO43497 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA1GO43497 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNA1GO43497 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CACNA1GO43497 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CACNA1GO43497 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA1GO43497 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA1GO43497 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA1GO43497 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA1GO43497 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA1GO43497 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNA1GO43497 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA1GO43497 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNA1GO43497 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA1GO43497 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA1GO43497 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNA1GO43497 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNA1GO43497 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA1GO43497 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA1GO43497 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNA1GO43497 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNA1GO43497 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNA1GO43497 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
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