Protein–RNA interactions for Protein: O43399

TPD52L2, Tumor protein D54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L2O43399 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPD52L2O43399 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPD52L2O43399 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPD52L2O43399 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPD52L2O43399 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPD52L2O43399 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPD52L2O43399 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPD52L2O43399 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPD52L2O43399 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPD52L2O43399 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPD52L2O43399 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TPD52L2O43399 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPD52L2O43399 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPD52L2O43399 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPD52L2O43399 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPD52L2O43399 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPD52L2O43399 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPD52L2O43399 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPD52L2O43399 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPD52L2O43399 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPD52L2O43399 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPD52L2O43399 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPD52L2O43399 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPD52L2O43399 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPD52L2O43399 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPD52L2O43399 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPD52L2O43399 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TPD52L2O43399 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPD52L2O43399 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPD52L2O43399 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPD52L2O43399 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPD52L2O43399 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPD52L2O43399 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPD52L2O43399 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPD52L2O43399 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPD52L2O43399 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPD52L2O43399 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPD52L2O43399 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPD52L2O43399 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPD52L2O43399 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPD52L2O43399 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPD52L2O43399 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPD52L2O43399 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPD52L2O43399 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPD52L2O43399 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPD52L2O43399 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPD52L2O43399 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPD52L2O43399 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPD52L2O43399 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPD52L2O43399 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TPD52L2O43399 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPD52L2O43399 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TPD52L2O43399 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPD52L2O43399 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPD52L2O43399 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TPD52L2O43399 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPD52L2O43399 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TPD52L2O43399 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TPD52L2O43399 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TPD52L2O43399 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPD52L2O43399 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TPD52L2O43399 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TPD52L2O43399 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPD52L2O43399 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPD52L2O43399 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TPD52L2O43399 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TPD52L2O43399 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TPD52L2O43399 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TPD52L2O43399 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TPD52L2O43399 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TPD52L2O43399 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TPD52L2O43399 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPD52L2O43399 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPD52L2O43399 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPD52L2O43399 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPD52L2O43399 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPD52L2O43399 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPD52L2O43399 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPD52L2O43399 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPD52L2O43399 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPD52L2O43399 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPD52L2O43399 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TPD52L2O43399 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPD52L2O43399 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPD52L2O43399 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPD52L2O43399 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPD52L2O43399 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPD52L2O43399 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPD52L2O43399 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPD52L2O43399 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPD52L2O43399 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPD52L2O43399 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPD52L2O43399 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPD52L2O43399 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPD52L2O43399 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPD52L2O43399 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPD52L2O43399 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TPD52L2O43399 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TPD52L2O43399 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TPD52L2O43399 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms