Protein–RNA interactions for Protein: O15540

FABP7, Fatty acid-binding protein, brain, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FABP7O15540 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FABP7O15540 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FABP7O15540 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FABP7O15540 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FABP7O15540 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FABP7O15540 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FABP7O15540 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FABP7O15540 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FABP7O15540 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FABP7O15540 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FABP7O15540 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FABP7O15540 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FABP7O15540 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FABP7O15540 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FABP7O15540 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FABP7O15540 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FABP7O15540 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FABP7O15540 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FABP7O15540 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FABP7O15540 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FABP7O15540 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FABP7O15540 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FABP7O15540 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FABP7O15540 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FABP7O15540 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FABP7O15540 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FABP7O15540 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FABP7O15540 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FABP7O15540 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FABP7O15540 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FABP7O15540 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FABP7O15540 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FABP7O15540 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FABP7O15540 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FABP7O15540 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FABP7O15540 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FABP7O15540 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FABP7O15540 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FABP7O15540 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FABP7O15540 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FABP7O15540 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FABP7O15540 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FABP7O15540 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FABP7O15540 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FABP7O15540 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FABP7O15540 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FABP7O15540 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FABP7O15540 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FABP7O15540 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FABP7O15540 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FABP7O15540 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FABP7O15540 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FABP7O15540 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FABP7O15540 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FABP7O15540 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FABP7O15540 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FABP7O15540 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FABP7O15540 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FABP7O15540 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FABP7O15540 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FABP7O15540 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FABP7O15540 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FABP7O15540 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FABP7O15540 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FABP7O15540 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FABP7O15540 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FABP7O15540 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FABP7O15540 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FABP7O15540 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FABP7O15540 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FABP7O15540 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FABP7O15540 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FABP7O15540 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FABP7O15540 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FABP7O15540 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FABP7O15540 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FABP7O15540 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FABP7O15540 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FABP7O15540 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FABP7O15540 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FABP7O15540 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FABP7O15540 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FABP7O15540 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FABP7O15540 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FABP7O15540 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FABP7O15540 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FABP7O15540 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FABP7O15540 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FABP7O15540 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FABP7O15540 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FABP7O15540 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FABP7O15540 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FABP7O15540 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FABP7O15540 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FABP7O15540 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FABP7O15540 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FABP7O15540 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FABP7O15540 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FABP7O15540 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FABP7O15540 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms