Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
IKBKBO14920 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
IKBKBO14920 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
IKBKBO14920 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
IKBKBO14920 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
IKBKBO14920 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
IKBKBO14920 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
IKBKBO14920 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
IKBKBO14920 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
IKBKBO14920 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
IKBKBO14920 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
IKBKBO14920 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
IKBKBO14920 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
IKBKBO14920 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
IKBKBO14920 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
IKBKBO14920 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
IKBKBO14920 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
IKBKBO14920 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
IKBKBO14920 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
IKBKBO14920 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
IKBKBO14920 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
IKBKBO14920 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
IKBKBO14920 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
IKBKBO14920 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
IKBKBO14920 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
IKBKBO14920 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
IKBKBO14920 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
IKBKBO14920 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
IKBKBO14920 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
IKBKBO14920 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
IKBKBO14920 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
IKBKBO14920 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
IKBKBO14920 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
IKBKBO14920 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
IKBKBO14920 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
IKBKBO14920 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
IKBKBO14920 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
IKBKBO14920 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
IKBKBO14920 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
IKBKBO14920 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
IKBKBO14920 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
IKBKBO14920 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
IKBKBO14920 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
IKBKBO14920 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
IKBKBO14920 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
IKBKBO14920 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
IKBKBO14920 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
IKBKBO14920 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
IKBKBO14920 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
IKBKBO14920 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
IKBKBO14920 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
IKBKBO14920 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
IKBKBO14920 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
IKBKBO14920 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
IKBKBO14920 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
IKBKBO14920 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
IKBKBO14920 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
IKBKBO14920 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
IKBKBO14920 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
IKBKBO14920 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
IKBKBO14920 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
IKBKBO14920 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
IKBKBO14920 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
IKBKBO14920 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
IKBKBO14920 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
IKBKBO14920 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
IKBKBO14920 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
IKBKBO14920 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
IKBKBO14920 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
IKBKBO14920 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
IKBKBO14920 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
IKBKBO14920 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
IKBKBO14920 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
IKBKBO14920 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
IKBKBO14920 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
IKBKBO14920 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
IKBKBO14920 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
IKBKBO14920 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
IKBKBO14920 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
IKBKBO14920 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
IKBKBO14920 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
IKBKBO14920 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
IKBKBO14920 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
IKBKBO14920 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
IKBKBO14920 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
IKBKBO14920 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
IKBKBO14920 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
IKBKBO14920 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
IKBKBO14920 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
IKBKBO14920 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
IKBKBO14920 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
IKBKBO14920 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
IKBKBO14920 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
IKBKBO14920 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
IKBKBO14920 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
IKBKBO14920 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
IKBKBO14920 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
IKBKBO14920 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
IKBKBO14920 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
IKBKBO14920 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms