Protein–RNA interactions for Protein: O14649

KCNK3, Potassium channel subfamily K member 3, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK3O14649 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNK3O14649 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNK3O14649 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNK3O14649 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KCNK3O14649 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KCNK3O14649 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNK3O14649 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KCNK3O14649 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
KCNK3O14649 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KCNK3O14649 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNK3O14649 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KCNK3O14649 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNK3O14649 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNK3O14649 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KCNK3O14649 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCNK3O14649 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KCNK3O14649 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KCNK3O14649 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KCNK3O14649 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KCNK3O14649 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCNK3O14649 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KCNK3O14649 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KCNK3O14649 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCNK3O14649 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCNK3O14649 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNK3O14649 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCNK3O14649 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KCNK3O14649 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KCNK3O14649 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCNK3O14649 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCNK3O14649 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNK3O14649 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCNK3O14649 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCNK3O14649 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCNK3O14649 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KCNK3O14649 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KCNK3O14649 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KCNK3O14649 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCNK3O14649 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCNK3O14649 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCNK3O14649 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNK3O14649 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNK3O14649 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
KCNK3O14649 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCNK3O14649 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCNK3O14649 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCNK3O14649 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCNK3O14649 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KCNK3O14649 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KCNK3O14649 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KCNK3O14649 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KCNK3O14649 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNK3O14649 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNK3O14649 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KCNK3O14649 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCNK3O14649 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCNK3O14649 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCNK3O14649 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KCNK3O14649 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KCNK3O14649 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNK3O14649 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNK3O14649 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNK3O14649 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNK3O14649 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
KCNK3O14649 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KCNK3O14649 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNK3O14649 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNK3O14649 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNK3O14649 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNK3O14649 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNK3O14649 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNK3O14649 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNK3O14649 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNK3O14649 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNK3O14649 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNK3O14649 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNK3O14649 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNK3O14649 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNK3O14649 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNK3O14649 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNK3O14649 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KCNK3O14649 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNK3O14649 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNK3O14649 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNK3O14649 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KCNK3O14649 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNK3O14649 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNK3O14649 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNK3O14649 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KCNK3O14649 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNK3O14649 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNK3O14649 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNK3O14649 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNK3O14649 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNK3O14649 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KCNK3O14649 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCNK3O14649 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCNK3O14649 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNK3O14649 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNK3O14649 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms