Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.982e-17■■■■■ 84.9
DDX3XO00571 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.472e-17■■■■■ 84.9
DDX3XO00571 MRPL40-202ENST00000443660 954 ntTSL 214.45□□□□□ -0.12e-17■■■■■ 84.9
DDX3XO00571 PPP2R2C-202ENST00000335585 4092 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.462e-17■■■■■ 84.9
DDX3XO00571 DPH3-204ENST00000488423 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.862e-17■■■■■ 84.9
DDX3XO00571 DPH3-202ENST00000383775 3052 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.92e-17■■■■■ 84.9
DDX3XO00571 SMIM20-203ENST00000515764 773 ntTSL 58.02□□□□□ -1.132e-17■■■■■ 84.9
DDX3XO00571 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.182e-17■■■■■ 84.9
DDX3XO00571 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.211e-8■■■■■ 82.8
DDX3XO00571 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.121e-8■■■■■ 82.8
DDX3XO00571 GRINA-205ENST00000529301 1075 ntTSL 321.69■■□□□ 1.061e-8■■■■■ 82.8
DDX3XO00571 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 82.7
DDX3XO00571 APOC1-203ENST00000588802 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 82.7
DDX3XO00571 APOC1-205ENST00000589781 273 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 82.7
DDX3XO00571 APOC1-202ENST00000588750 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.051e-7■■■■■ 82.7
DDX3XO00571 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.461e-7■■■■■ 82.6
DDX3XO00571 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.261e-7■■■■■ 82.6
DDX3XO00571 FAM238C-203ENST00000640121 3620 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 82.6
DDX3XO00571 FAM238C-201ENST00000638416 868 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.611e-7■■■■■ 82.6
DDX3XO00571 FAM238C-205ENST00000640641 391 ntBASIC9.14□□□□□ -0.951e-7■■■■■ 82.6
DDX3XO00571 ZNF664-208ENST00000540009 753 ntTSL 323.41■■□□□ 1.343e-13■■■■■ 82.6
DDX3XO00571 ZNF664-212ENST00000542820 802 ntTSL 1 (best)22.7■■□□□ 1.223e-13■■■■■ 82.6
DDX3XO00571 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.422e-46■■■■■ 82.6
DDX3XO00571 APOE-204ENST00000446996 737 ntTSL 222.89■■□□□ 1.252e-46■■■■■ 82.6
DDX3XO00571 APOE-203ENST00000434152 864 ntTSL 221.02■□□□□ 0.962e-46■■■■■ 82.6
DDX3XO00571 ARIH2-204ENST00000433170 560 ntTSL 420.6■□□□□ 0.897e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-226ENST00000488963 517 ntTSL 320.6■□□□□ 0.897e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-218ENST00000474936 695 ntTSL 220.6■□□□□ 0.897e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-224ENST00000486316 406 ntTSL 419■□□□□ 0.637e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-227ENST00000490095 1001 ntTSL 519■□□□□ 0.637e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-202ENST00000420814 884 ntTSL 319■□□□□ 0.637e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-211ENST00000463738 528 ntTSL 419■□□□□ 0.637e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-230ENST00000495761 569 ntTSL 318.67■□□□□ 0.587e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-228ENST00000492077 731 ntTSL 218.34■□□□□ 0.537e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-219ENST00000478224 507 ntTSL 317.79■□□□□ 0.447e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-206ENST00000449729 678 ntTSL 217.29■□□□□ 0.367e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.277e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-222ENST00000483333 674 ntTSL 516.29■□□□□ 0.27e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-221ENST00000482427 556 ntTSL 416.29■□□□□ 0.27e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-217ENST00000474618 566 ntTSL 316.29■□□□□ 0.27e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-231ENST00000498314 649 ntTSL 416.03■□□□□ 0.167e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-203ENST00000430423 753 ntTSL 216.03■□□□□ 0.167e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-208ENST00000452882 598 ntTSL 315.99■□□□□ 0.157e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 ARIH2-201ENST00000356401 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.627e-10■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 GALNT11-212ENST00000482812 580 ntTSL 423.91■■□□□ 1.425e-14■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.65e-14■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 GALNT11-210ENST00000447778 1231 ntTSL 517.68■□□□□ 0.425e-14■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 GALNT11-209ENST00000446096 521 ntTSL 317.49■□□□□ 0.395e-14■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 GALNT11-204ENST00000423337 580 ntTSL 315.83■□□□□ 0.125e-14■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 GALNT11-206ENST00000431668 626 ntTSL 315.06■□□□□ 05e-14■■■■■ 82.5
DDX3XO00571 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.418e-17■■■■■ 82.3
DDX3XO00571 RAB9A-201ENST00000243325 393 ntTSL 316.93■□□□□ 0.38e-17■■■■■ 82.3
DDX3XO00571 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.38e-17■■■■■ 82.3
DDX3XO00571 MRPL40-203ENST00000471259 942 ntTSL 211.01□□□□□ -0.654e-17■■■■■ 82.3
DDX3XO00571 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.929e-9■■■■■ 82.2
DDX3XO00571 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.779e-9■■■■■ 82.2
DDX3XO00571 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.689e-9■■■■■ 82.2
DDX3XO00571 COPS9-202ENST00000403160 609 ntTSL 217.19■□□□□ 0.348e-9■■■■■ 81
DDX3XO00571 GSTK1-208ENST00000489654 875 ntTSL 217.89■□□□□ 0.452e-32■■■■■ 80.8
DDX3XO00571 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.372e-32■■■■■ 80.8
DDX3XO00571 GSTK1-209ENST00000494735 832 ntTSL 216.87■□□□□ 0.292e-32■■■■■ 80.8
DDX3XO00571 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.12e-32■■■■■ 80.8
DDX3XO00571 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.242e-32■■■■■ 80.8
DDX3XO00571 GSTK1-204ENST00000442394 2219 ntTSL 512.76□□□□□ -0.372e-32■■■■■ 80.8
DDX3XO00571 GSTK1-203ENST00000436038 556 ntTSL 512.43□□□□□ -0.422e-32■■■■■ 80.8
DDX3XO00571 GSTK1-205ENST00000443571 850 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.482e-32■■■■■ 80.8
DDX3XO00571 GSTK1-206ENST00000473649 2692 ntTSL 29.53□□□□□ -0.882e-32■■■■■ 80.8
DDX3XO00571 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.618e-14■■■■■ 80.6
DDX3XO00571 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.074e-11■■■■■ 80.4
DDX3XO00571 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.974e-11■■■■■ 80.4
DDX3XO00571 ABHD14A-203ENST00000474575 1064 ntTSL 220.99■□□□□ 0.954e-11■■■■■ 80.4
DDX3XO00571 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.864e-11■■■■■ 80.4
DDX3XO00571 ABHD14A-206ENST00000497864 802 ntTSL 219.6■□□□□ 0.734e-11■■■■■ 80.4
DDX3XO00571 ABHD14A-205ENST00000494478 626 ntTSL 312.99□□□□□ -0.334e-11■■■■■ 80.4
DDX3XO00571 CDS2-204ENST00000467923 783 ntTSL 323.82■■□□□ 1.44e-15■■■■■ 80.3
DDX3XO00571 CDS2-202ENST00000450570 945 ntTSL 323.71■■□□□ 1.394e-15■■■■■ 80.3
DDX3XO00571 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.024e-15■■■■■ 80.3
DDX3XO00571 CDS2-205ENST00000468817 2706 ntTSL 214.7□□□□□ -0.064e-15■■■■■ 80.3
DDX3XO00571 CDS2-206ENST00000486875 709 ntTSL 212.49□□□□□ -0.414e-15■■■■■ 80.3
DDX3XO00571 AREG-201ENST00000395748 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.361e-11■■■■■ 80
DDX3XO00571 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.716e-18■■■■■ 79.8
DDX3XO00571 TP73-AS1-204ENST00000452079 6358 ntTSL 1 (best)15.19■□□□□ 0.026e-18■■■■■ 79.8
DDX3XO00571 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -09e-27■■■■■ 79.7
DDX3XO00571 SYCP2L-202ENST00000341041 3069 ntTSL 213.02□□□□□ -0.339e-27■■■■■ 79.7
DDX3XO00571 UBE2D4-205ENST00000443780 743 ntTSL 320.83■□□□□ 0.933e-16■■■■■ 79.6
DDX3XO00571 UBE2D4-207ENST00000450743 849 ntTSL 220.83■□□□□ 0.933e-16■■■■■ 79.6
DDX3XO00571 UBE2D4-208ENST00000454350 789 ntTSL 218.71■□□□□ 0.593e-16■■■■■ 79.6
DDX3XO00571 UBE2D4-209ENST00000454428 288 ntTSL 316.73■□□□□ 0.273e-16■■■■■ 79.6
DDX3XO00571 UBE2D4-202ENST00000415051 921 ntTSL 316.73■□□□□ 0.273e-16■■■■■ 79.6
DDX3XO00571 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.183e-16■■■■■ 79.6
DDX3XO00571 UBE2D4-204ENST00000440899 1040 ntTSL 511.66□□□□□ -0.543e-16■■■■■ 79.6
DDX3XO00571 UBE2D4-206ENST00000446008 783 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.883e-16■■■■■ 79.6
DDX3XO00571 UBE2D4-203ENST00000440652 1299 ntTSL 27.29□□□□□ -1.243e-16■■■■■ 79.6
DDX3XO00571 GTF3A-203ENST00000435781 688 ntTSL 521.71■■□□□ 1.075e-21■■■■■ 78.7
DDX3XO00571 GTF3A-202ENST00000419181 1191 ntTSL 1 (best)20.87■□□□□ 0.935e-21■■■■■ 78.7
DDX3XO00571 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.825e-21■■■■■ 78.7
DDX3XO00571 GTF3A-204ENST00000438571 792 ntTSL 518.24■□□□□ 0.515e-21■■■■■ 78.7
DDX3XO00571 APOE-205ENST00000485628 771 ntTSL 1 (best)16.8■□□□□ 0.282e-11■■■■■ 78.5
DDX3XO00571 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.046e-13■■■■■ 78.5
DDX3XO00571 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.896e-13■■■■■ 78.5
Retrieved 100 of 47,714 protein–RNA pairs in 3888.6 ms