Protein–RNA interactions for Protein: O00115

DNASE2, Deoxyribonuclease-2-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE2O00115 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNASE2O00115 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNASE2O00115 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DNASE2O00115 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNASE2O00115 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNASE2O00115 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNASE2O00115 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNASE2O00115 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNASE2O00115 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNASE2O00115 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNASE2O00115 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNASE2O00115 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNASE2O00115 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNASE2O00115 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNASE2O00115 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNASE2O00115 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNASE2O00115 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNASE2O00115 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNASE2O00115 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNASE2O00115 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNASE2O00115 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNASE2O00115 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNASE2O00115 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNASE2O00115 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNASE2O00115 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNASE2O00115 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNASE2O00115 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNASE2O00115 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DNASE2O00115 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNASE2O00115 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DNASE2O00115 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNASE2O00115 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DNASE2O00115 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNASE2O00115 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNASE2O00115 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNASE2O00115 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNASE2O00115 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNASE2O00115 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNASE2O00115 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNASE2O00115 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNASE2O00115 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNASE2O00115 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNASE2O00115 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNASE2O00115 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNASE2O00115 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNASE2O00115 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNASE2O00115 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNASE2O00115 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DNASE2O00115 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNASE2O00115 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DNASE2O00115 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNASE2O00115 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNASE2O00115 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNASE2O00115 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNASE2O00115 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNASE2O00115 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNASE2O00115 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNASE2O00115 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNASE2O00115 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNASE2O00115 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNASE2O00115 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DNASE2O00115 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNASE2O00115 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNASE2O00115 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNASE2O00115 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNASE2O00115 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNASE2O00115 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNASE2O00115 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNASE2O00115 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNASE2O00115 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNASE2O00115 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNASE2O00115 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DNASE2O00115 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNASE2O00115 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNASE2O00115 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNASE2O00115 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNASE2O00115 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNASE2O00115 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNASE2O00115 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNASE2O00115 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNASE2O00115 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNASE2O00115 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNASE2O00115 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNASE2O00115 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNASE2O00115 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNASE2O00115 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNASE2O00115 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNASE2O00115 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNASE2O00115 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNASE2O00115 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNASE2O00115 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNASE2O00115 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNASE2O00115 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNASE2O00115 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNASE2O00115 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNASE2O00115 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNASE2O00115 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNASE2O00115 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNASE2O00115 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNASE2O00115 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms