Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
J3QR89 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3QR89 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
J3QR89 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3QR89 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3QR89 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3QR89 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3QR89 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
J3QR89 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
J3QR89 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
J3QR89 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
J3QR89 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3QR89 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3QR89 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3QR89 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3QR89 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3QR89 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
J3QR89 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
J3QR89 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
J3QR89 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
J3QR89 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
J3QR89 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
J3QR89 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
J3QR89 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3QR89 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
J3QR89 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
J3QR89 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
J3QR89 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
J3QR89 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
J3QR89 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
J3QR89 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3QR89 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3QR89 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3QR89 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3QR89 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
J3QR89 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
J3QR89 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3QR89 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
J3QR89 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3QR89 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3QR89 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3QR89 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
J3QR89 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3QR89 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3QR89 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
J3QR89 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
J3QR89 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3QR89 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
J3QR89 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
J3QR89 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QR89 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
J3QR89 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QR89 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QR89 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
J3QR89 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
J3QR89 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QR89 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QR89 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QR89 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
J3QR89 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QR89 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QR89 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
J3QR89 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QR89 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
J3QR89 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
J3QR89 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QR89 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
J3QR89 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QR89 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
J3QR89 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3QR89 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
J3QR89 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QR89 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QR89 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QR89 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3QR89 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3QR89 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
J3QR89 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3QR89 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3QR89 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3QR89 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3QR89 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3QR89 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3QR89 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3QR89 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3QR89 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3QR89 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3QR89 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3QR89 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3QR89 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3QR89 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3QR89 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3QR89 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
J3QR89 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
J3QR89 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
J3QR89 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
J3QR89 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
J3QR89 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QR89 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
J3QR89 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms