Protein–RNA interactions for Protein: H3BV60

TGFBR3L, Transforming growth factor-beta receptor type 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3LH3BV60 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TGFBR3LH3BV60 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TGFBR3LH3BV60 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TGFBR3LH3BV60 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TGFBR3LH3BV60 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TGFBR3LH3BV60 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TGFBR3LH3BV60 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TGFBR3LH3BV60 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TGFBR3LH3BV60 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TGFBR3LH3BV60 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TGFBR3LH3BV60 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TGFBR3LH3BV60 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TGFBR3LH3BV60 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TGFBR3LH3BV60 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TGFBR3LH3BV60 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TGFBR3LH3BV60 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TGFBR3LH3BV60 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TGFBR3LH3BV60 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TGFBR3LH3BV60 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TGFBR3LH3BV60 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TGFBR3LH3BV60 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TGFBR3LH3BV60 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TGFBR3LH3BV60 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TGFBR3LH3BV60 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TGFBR3LH3BV60 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TGFBR3LH3BV60 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TGFBR3LH3BV60 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TGFBR3LH3BV60 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TGFBR3LH3BV60 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TGFBR3LH3BV60 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TGFBR3LH3BV60 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TGFBR3LH3BV60 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TGFBR3LH3BV60 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TGFBR3LH3BV60 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TGFBR3LH3BV60 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TGFBR3LH3BV60 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TGFBR3LH3BV60 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TGFBR3LH3BV60 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TGFBR3LH3BV60 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TGFBR3LH3BV60 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TGFBR3LH3BV60 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TGFBR3LH3BV60 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TGFBR3LH3BV60 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TGFBR3LH3BV60 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TGFBR3LH3BV60 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TGFBR3LH3BV60 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TGFBR3LH3BV60 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TGFBR3LH3BV60 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TGFBR3LH3BV60 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TGFBR3LH3BV60 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TGFBR3LH3BV60 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TGFBR3LH3BV60 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TGFBR3LH3BV60 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TGFBR3LH3BV60 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TGFBR3LH3BV60 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TGFBR3LH3BV60 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TGFBR3LH3BV60 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TGFBR3LH3BV60 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TGFBR3LH3BV60 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TGFBR3LH3BV60 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TGFBR3LH3BV60 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TGFBR3LH3BV60 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TGFBR3LH3BV60 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TGFBR3LH3BV60 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TGFBR3LH3BV60 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TGFBR3LH3BV60 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TGFBR3LH3BV60 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TGFBR3LH3BV60 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TGFBR3LH3BV60 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TGFBR3LH3BV60 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TGFBR3LH3BV60 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TGFBR3LH3BV60 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TGFBR3LH3BV60 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TGFBR3LH3BV60 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TGFBR3LH3BV60 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TGFBR3LH3BV60 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TGFBR3LH3BV60 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TGFBR3LH3BV60 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TGFBR3LH3BV60 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TGFBR3LH3BV60 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TGFBR3LH3BV60 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TGFBR3LH3BV60 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TGFBR3LH3BV60 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TGFBR3LH3BV60 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TGFBR3LH3BV60 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TGFBR3LH3BV60 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TGFBR3LH3BV60 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TGFBR3LH3BV60 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TGFBR3LH3BV60 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TGFBR3LH3BV60 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TGFBR3LH3BV60 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TGFBR3LH3BV60 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGFBR3LH3BV60 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGFBR3LH3BV60 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TGFBR3LH3BV60 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGFBR3LH3BV60 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TGFBR3LH3BV60 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TGFBR3LH3BV60 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TGFBR3LH3BV60 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TGFBR3LH3BV60 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms