Protein–RNA interactions for Protein: A8MVA2

KRTAP9-6, Keratin-associated protein 9-6, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-6A8MVA2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
KRTAP9-6A8MVA2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
KRTAP9-6A8MVA2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
KRTAP9-6A8MVA2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
KRTAP9-6A8MVA2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
KRTAP9-6A8MVA2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
KRTAP9-6A8MVA2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
KRTAP9-6A8MVA2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
KRTAP9-6A8MVA2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
KRTAP9-6A8MVA2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
KRTAP9-6A8MVA2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
KRTAP9-6A8MVA2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
KRTAP9-6A8MVA2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
KRTAP9-6A8MVA2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
KRTAP9-6A8MVA2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-6A8MVA2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-6A8MVA2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-6A8MVA2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-6A8MVA2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-6A8MVA2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-6A8MVA2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-6A8MVA2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-6A8MVA2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-6A8MVA2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-6A8MVA2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-6A8MVA2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
KRTAP9-6A8MVA2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
KRTAP9-6A8MVA2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
KRTAP9-6A8MVA2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
KRTAP9-6A8MVA2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
KRTAP9-6A8MVA2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-6A8MVA2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-6A8MVA2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-6A8MVA2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-6A8MVA2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-6A8MVA2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-6A8MVA2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
KRTAP9-6A8MVA2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-6A8MVA2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
KRTAP9-6A8MVA2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms