Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VGLL3A8MV65 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VGLL3A8MV65 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VGLL3A8MV65 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VGLL3A8MV65 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VGLL3A8MV65 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VGLL3A8MV65 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VGLL3A8MV65 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VGLL3A8MV65 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VGLL3A8MV65 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VGLL3A8MV65 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VGLL3A8MV65 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VGLL3A8MV65 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
VGLL3A8MV65 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VGLL3A8MV65 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
VGLL3A8MV65 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
VGLL3A8MV65 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VGLL3A8MV65 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VGLL3A8MV65 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VGLL3A8MV65 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VGLL3A8MV65 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VGLL3A8MV65 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VGLL3A8MV65 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VGLL3A8MV65 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VGLL3A8MV65 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VGLL3A8MV65 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VGLL3A8MV65 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VGLL3A8MV65 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VGLL3A8MV65 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VGLL3A8MV65 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
VGLL3A8MV65 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VGLL3A8MV65 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VGLL3A8MV65 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VGLL3A8MV65 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VGLL3A8MV65 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VGLL3A8MV65 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VGLL3A8MV65 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VGLL3A8MV65 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VGLL3A8MV65 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VGLL3A8MV65 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VGLL3A8MV65 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VGLL3A8MV65 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VGLL3A8MV65 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VGLL3A8MV65 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VGLL3A8MV65 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VGLL3A8MV65 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VGLL3A8MV65 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VGLL3A8MV65 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VGLL3A8MV65 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VGLL3A8MV65 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VGLL3A8MV65 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VGLL3A8MV65 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VGLL3A8MV65 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VGLL3A8MV65 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VGLL3A8MV65 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VGLL3A8MV65 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VGLL3A8MV65 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VGLL3A8MV65 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VGLL3A8MV65 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VGLL3A8MV65 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VGLL3A8MV65 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VGLL3A8MV65 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VGLL3A8MV65 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VGLL3A8MV65 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VGLL3A8MV65 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGLL3A8MV65 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGLL3A8MV65 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGLL3A8MV65 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VGLL3A8MV65 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VGLL3A8MV65 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VGLL3A8MV65 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VGLL3A8MV65 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VGLL3A8MV65 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VGLL3A8MV65 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VGLL3A8MV65 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VGLL3A8MV65 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VGLL3A8MV65 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VGLL3A8MV65 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VGLL3A8MV65 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VGLL3A8MV65 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VGLL3A8MV65 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VGLL3A8MV65 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VGLL3A8MV65 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VGLL3A8MV65 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VGLL3A8MV65 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VGLL3A8MV65 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VGLL3A8MV65 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VGLL3A8MV65 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VGLL3A8MV65 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VGLL3A8MV65 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VGLL3A8MV65 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VGLL3A8MV65 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
VGLL3A8MV65 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VGLL3A8MV65 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VGLL3A8MV65 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VGLL3A8MV65 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
VGLL3A8MV65 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VGLL3A8MV65 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VGLL3A8MV65 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VGLL3A8MV65 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms