Protein–RNA interactions for Protein: A6NKQ9

CGB1, Choriogonadotropin subunit beta variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB1A6NKQ9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGB1A6NKQ9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGB1A6NKQ9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGB1A6NKQ9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGB1A6NKQ9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGB1A6NKQ9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGB1A6NKQ9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGB1A6NKQ9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGB1A6NKQ9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGB1A6NKQ9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGB1A6NKQ9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGB1A6NKQ9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CGB1A6NKQ9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGB1A6NKQ9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CGB1A6NKQ9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGB1A6NKQ9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGB1A6NKQ9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGB1A6NKQ9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CGB1A6NKQ9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CGB1A6NKQ9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CGB1A6NKQ9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGB1A6NKQ9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGB1A6NKQ9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CGB1A6NKQ9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CGB1A6NKQ9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGB1A6NKQ9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGB1A6NKQ9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGB1A6NKQ9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGB1A6NKQ9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGB1A6NKQ9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGB1A6NKQ9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGB1A6NKQ9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGB1A6NKQ9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGB1A6NKQ9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGB1A6NKQ9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CGB1A6NKQ9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGB1A6NKQ9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGB1A6NKQ9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGB1A6NKQ9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGB1A6NKQ9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGB1A6NKQ9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGB1A6NKQ9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CGB1A6NKQ9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGB1A6NKQ9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGB1A6NKQ9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGB1A6NKQ9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGB1A6NKQ9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGB1A6NKQ9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGB1A6NKQ9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGB1A6NKQ9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CGB1A6NKQ9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGB1A6NKQ9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGB1A6NKQ9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGB1A6NKQ9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGB1A6NKQ9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGB1A6NKQ9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGB1A6NKQ9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGB1A6NKQ9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGB1A6NKQ9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CGB1A6NKQ9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGB1A6NKQ9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGB1A6NKQ9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGB1A6NKQ9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CGB1A6NKQ9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGB1A6NKQ9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGB1A6NKQ9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGB1A6NKQ9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CGB1A6NKQ9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGB1A6NKQ9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CGB1A6NKQ9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CGB1A6NKQ9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CGB1A6NKQ9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CGB1A6NKQ9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGB1A6NKQ9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CGB1A6NKQ9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CGB1A6NKQ9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGB1A6NKQ9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGB1A6NKQ9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CGB1A6NKQ9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CGB1A6NKQ9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CGB1A6NKQ9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CGB1A6NKQ9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CGB1A6NKQ9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CGB1A6NKQ9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CGB1A6NKQ9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CGB1A6NKQ9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CGB1A6NKQ9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CGB1A6NKQ9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CGB1A6NKQ9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CGB1A6NKQ9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CGB1A6NKQ9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CGB1A6NKQ9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CGB1A6NKQ9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CGB1A6NKQ9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CGB1A6NKQ9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGB1A6NKQ9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CGB1A6NKQ9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGB1A6NKQ9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CGB1A6NKQ9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CGB1A6NKQ9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms