Protein–RNA interactions for Protein: A6NFX1

MFSD2B, Major facilitator superfamily domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2BA6NFX1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MFSD2BA6NFX1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MFSD2BA6NFX1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD2BA6NFX1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFSD2BA6NFX1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFSD2BA6NFX1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFSD2BA6NFX1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFSD2BA6NFX1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFSD2BA6NFX1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFSD2BA6NFX1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFSD2BA6NFX1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD2BA6NFX1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFSD2BA6NFX1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MFSD2BA6NFX1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MFSD2BA6NFX1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MFSD2BA6NFX1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MFSD2BA6NFX1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MFSD2BA6NFX1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MFSD2BA6NFX1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MFSD2BA6NFX1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MFSD2BA6NFX1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MFSD2BA6NFX1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MFSD2BA6NFX1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD2BA6NFX1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MFSD2BA6NFX1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MFSD2BA6NFX1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MFSD2BA6NFX1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD2BA6NFX1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFSD2BA6NFX1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MFSD2BA6NFX1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD2BA6NFX1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFSD2BA6NFX1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFSD2BA6NFX1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD2BA6NFX1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD2BA6NFX1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD2BA6NFX1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFSD2BA6NFX1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD2BA6NFX1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD2BA6NFX1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD2BA6NFX1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD2BA6NFX1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFSD2BA6NFX1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MFSD2BA6NFX1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MFSD2BA6NFX1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD2BA6NFX1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MFSD2BA6NFX1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFSD2BA6NFX1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFSD2BA6NFX1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MFSD2BA6NFX1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD2BA6NFX1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MFSD2BA6NFX1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD2BA6NFX1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MFSD2BA6NFX1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD2BA6NFX1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MFSD2BA6NFX1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD2BA6NFX1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MFSD2BA6NFX1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD2BA6NFX1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD2BA6NFX1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MFSD2BA6NFX1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MFSD2BA6NFX1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MFSD2BA6NFX1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD2BA6NFX1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD2BA6NFX1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD2BA6NFX1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MFSD2BA6NFX1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD2BA6NFX1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD2BA6NFX1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD2BA6NFX1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFSD2BA6NFX1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD2BA6NFX1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD2BA6NFX1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFSD2BA6NFX1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFSD2BA6NFX1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD2BA6NFX1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFSD2BA6NFX1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MFSD2BA6NFX1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MFSD2BA6NFX1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD2BA6NFX1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD2BA6NFX1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD2BA6NFX1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD2BA6NFX1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD2BA6NFX1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD2BA6NFX1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD2BA6NFX1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD2BA6NFX1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD2BA6NFX1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD2BA6NFX1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD2BA6NFX1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MFSD2BA6NFX1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD2BA6NFX1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD2BA6NFX1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD2BA6NFX1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD2BA6NFX1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD2BA6NFX1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD2BA6NFX1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD2BA6NFX1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD2BA6NFX1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD2BA6NFX1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD2BA6NFX1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms