Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CTAGE9A4FU28 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CTAGE9A4FU28 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CTAGE9A4FU28 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CTAGE9A4FU28 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CTAGE9A4FU28 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CTAGE9A4FU28 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CTAGE9A4FU28 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CTAGE9A4FU28 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CTAGE9A4FU28 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CTAGE9A4FU28 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CTAGE9A4FU28 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CTAGE9A4FU28 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CTAGE9A4FU28 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CTAGE9A4FU28 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CTAGE9A4FU28 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CTAGE9A4FU28 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CTAGE9A4FU28 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CTAGE9A4FU28 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTAGE9A4FU28 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CTAGE9A4FU28 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CTAGE9A4FU28 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CTAGE9A4FU28 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CTAGE9A4FU28 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTAGE9A4FU28 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTAGE9A4FU28 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CTAGE9A4FU28 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CTAGE9A4FU28 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CTAGE9A4FU28 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CTAGE9A4FU28 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CTAGE9A4FU28 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CTAGE9A4FU28 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CTAGE9A4FU28 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CTAGE9A4FU28 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTAGE9A4FU28 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTAGE9A4FU28 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTAGE9A4FU28 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTAGE9A4FU28 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CTAGE9A4FU28 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTAGE9A4FU28 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CTAGE9A4FU28 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTAGE9A4FU28 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTAGE9A4FU28 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTAGE9A4FU28 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CTAGE9A4FU28 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CTAGE9A4FU28 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CTAGE9A4FU28 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CTAGE9A4FU28 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTAGE9A4FU28 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CTAGE9A4FU28 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTAGE9A4FU28 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTAGE9A4FU28 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTAGE9A4FU28 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTAGE9A4FU28 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTAGE9A4FU28 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTAGE9A4FU28 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTAGE9A4FU28 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTAGE9A4FU28 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTAGE9A4FU28 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTAGE9A4FU28 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTAGE9A4FU28 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTAGE9A4FU28 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTAGE9A4FU28 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTAGE9A4FU28 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CTAGE9A4FU28 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTAGE9A4FU28 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTAGE9A4FU28 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CTAGE9A4FU28 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CTAGE9A4FU28 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTAGE9A4FU28 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CTAGE9A4FU28 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTAGE9A4FU28 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTAGE9A4FU28 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTAGE9A4FU28 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTAGE9A4FU28 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTAGE9A4FU28 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTAGE9A4FU28 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTAGE9A4FU28 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTAGE9A4FU28 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTAGE9A4FU28 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTAGE9A4FU28 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTAGE9A4FU28 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTAGE9A4FU28 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTAGE9A4FU28 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTAGE9A4FU28 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CTAGE9A4FU28 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
CTAGE9A4FU28 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTAGE9A4FU28 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTAGE9A4FU28 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTAGE9A4FU28 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTAGE9A4FU28 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTAGE9A4FU28 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTAGE9A4FU28 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTAGE9A4FU28 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTAGE9A4FU28 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTAGE9A4FU28 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTAGE9A4FU28 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTAGE9A4FU28 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTAGE9A4FU28 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTAGE9A4FU28 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms