Protein–RNA interactions for Protein: A1X283

SH3PXD2B, SH3 and PX domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3PXD2BA1X283 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH3PXD2BA1X283 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH3PXD2BA1X283 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SH3PXD2BA1X283 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SH3PXD2BA1X283 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3PXD2BA1X283 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SH3PXD2BA1X283 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3PXD2BA1X283 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3PXD2BA1X283 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3PXD2BA1X283 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3PXD2BA1X283 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SH3PXD2BA1X283 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3PXD2BA1X283 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SH3PXD2BA1X283 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3PXD2BA1X283 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3PXD2BA1X283 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SH3PXD2BA1X283 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3PXD2BA1X283 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SH3PXD2BA1X283 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3PXD2BA1X283 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SH3PXD2BA1X283 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SH3PXD2BA1X283 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3PXD2BA1X283 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SH3PXD2BA1X283 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SH3PXD2BA1X283 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SH3PXD2BA1X283 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3PXD2BA1X283 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SH3PXD2BA1X283 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH3PXD2BA1X283 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SH3PXD2BA1X283 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH3PXD2BA1X283 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3PXD2BA1X283 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3PXD2BA1X283 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH3PXD2BA1X283 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH3PXD2BA1X283 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH3PXD2BA1X283 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3PXD2BA1X283 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH3PXD2BA1X283 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3PXD2BA1X283 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3PXD2BA1X283 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3PXD2BA1X283 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3PXD2BA1X283 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SH3PXD2BA1X283 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH3PXD2BA1X283 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3PXD2BA1X283 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3PXD2BA1X283 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3PXD2BA1X283 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3PXD2BA1X283 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3PXD2BA1X283 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3PXD2BA1X283 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3PXD2BA1X283 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3PXD2BA1X283 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3PXD2BA1X283 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3PXD2BA1X283 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3PXD2BA1X283 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3PXD2BA1X283 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3PXD2BA1X283 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3PXD2BA1X283 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3PXD2BA1X283 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3PXD2BA1X283 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3PXD2BA1X283 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3PXD2BA1X283 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3PXD2BA1X283 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3PXD2BA1X283 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3PXD2BA1X283 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3PXD2BA1X283 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3PXD2BA1X283 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3PXD2BA1X283 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3PXD2BA1X283 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SH3PXD2BA1X283 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SH3PXD2BA1X283 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SH3PXD2BA1X283 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SH3PXD2BA1X283 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SH3PXD2BA1X283 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3PXD2BA1X283 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3PXD2BA1X283 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3PXD2BA1X283 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SH3PXD2BA1X283 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SH3PXD2BA1X283 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3PXD2BA1X283 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SH3PXD2BA1X283 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3PXD2BA1X283 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3PXD2BA1X283 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SH3PXD2BA1X283 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SH3PXD2BA1X283 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SH3PXD2BA1X283 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SH3PXD2BA1X283 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3PXD2BA1X283 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SH3PXD2BA1X283 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3PXD2BA1X283 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SH3PXD2BA1X283 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SH3PXD2BA1X283 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3PXD2BA1X283 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3PXD2BA1X283 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SH3PXD2BA1X283 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3PXD2BA1X283 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SH3PXD2BA1X283 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3PXD2BA1X283 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3PXD2BA1X283 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SH3PXD2BA1X283 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms