Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SYCE3A1L190 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
SYCE3A1L190 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SYCE3A1L190 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SYCE3A1L190 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SYCE3A1L190 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SYCE3A1L190 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SYCE3A1L190 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SYCE3A1L190 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SYCE3A1L190 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SYCE3A1L190 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SYCE3A1L190 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SYCE3A1L190 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SYCE3A1L190 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SYCE3A1L190 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SYCE3A1L190 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SYCE3A1L190 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SYCE3A1L190 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SYCE3A1L190 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SYCE3A1L190 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SYCE3A1L190 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SYCE3A1L190 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SYCE3A1L190 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SYCE3A1L190 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SYCE3A1L190 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SYCE3A1L190 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SYCE3A1L190 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYCE3A1L190 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
SYCE3A1L190 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYCE3A1L190 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SYCE3A1L190 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SYCE3A1L190 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
SYCE3A1L190 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SYCE3A1L190 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYCE3A1L190 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYCE3A1L190 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYCE3A1L190 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYCE3A1L190 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYCE3A1L190 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYCE3A1L190 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYCE3A1L190 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYCE3A1L190 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYCE3A1L190 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SYCE3A1L190 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SYCE3A1L190 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SYCE3A1L190 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SYCE3A1L190 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SYCE3A1L190 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SYCE3A1L190 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SYCE3A1L190 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SYCE3A1L190 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYCE3A1L190 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
SYCE3A1L190 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYCE3A1L190 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYCE3A1L190 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYCE3A1L190 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
SYCE3A1L190 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYCE3A1L190 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SYCE3A1L190 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
SYCE3A1L190 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SYCE3A1L190 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SYCE3A1L190 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SYCE3A1L190 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
SYCE3A1L190 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
SYCE3A1L190 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SYCE3A1L190 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SYCE3A1L190 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SYCE3A1L190 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SYCE3A1L190 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SYCE3A1L190 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYCE3A1L190 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SYCE3A1L190 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SYCE3A1L190 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SYCE3A1L190 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SYCE3A1L190 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SYCE3A1L190 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SYCE3A1L190 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SYCE3A1L190 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SYCE3A1L190 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SYCE3A1L190 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SYCE3A1L190 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SYCE3A1L190 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SYCE3A1L190 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SYCE3A1L190 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SYCE3A1L190 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SYCE3A1L190 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SYCE3A1L190 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SYCE3A1L190 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SYCE3A1L190 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SYCE3A1L190 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SYCE3A1L190 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SYCE3A1L190 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SYCE3A1L190 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SYCE3A1L190 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SYCE3A1L190 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SYCE3A1L190 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYCE3A1L190 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SYCE3A1L190 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SYCE3A1L190 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SYCE3A1L190 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms