Protein–RNA interactions for Protein: A0PJX0

CIB4, Calcium and integrin-binding family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB4A0PJX0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CIB4A0PJX0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CIB4A0PJX0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CIB4A0PJX0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CIB4A0PJX0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CIB4A0PJX0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIB4A0PJX0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CIB4A0PJX0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CIB4A0PJX0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CIB4A0PJX0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CIB4A0PJX0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CIB4A0PJX0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CIB4A0PJX0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CIB4A0PJX0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CIB4A0PJX0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIB4A0PJX0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIB4A0PJX0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CIB4A0PJX0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CIB4A0PJX0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CIB4A0PJX0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CIB4A0PJX0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CIB4A0PJX0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CIB4A0PJX0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CIB4A0PJX0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CIB4A0PJX0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CIB4A0PJX0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CIB4A0PJX0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CIB4A0PJX0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CIB4A0PJX0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CIB4A0PJX0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CIB4A0PJX0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CIB4A0PJX0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CIB4A0PJX0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CIB4A0PJX0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CIB4A0PJX0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CIB4A0PJX0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CIB4A0PJX0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CIB4A0PJX0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CIB4A0PJX0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CIB4A0PJX0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CIB4A0PJX0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CIB4A0PJX0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CIB4A0PJX0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIB4A0PJX0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CIB4A0PJX0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIB4A0PJX0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIB4A0PJX0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CIB4A0PJX0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CIB4A0PJX0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CIB4A0PJX0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CIB4A0PJX0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CIB4A0PJX0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CIB4A0PJX0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CIB4A0PJX0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CIB4A0PJX0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CIB4A0PJX0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CIB4A0PJX0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CIB4A0PJX0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CIB4A0PJX0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CIB4A0PJX0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CIB4A0PJX0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CIB4A0PJX0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIB4A0PJX0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CIB4A0PJX0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIB4A0PJX0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIB4A0PJX0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CIB4A0PJX0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIB4A0PJX0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CIB4A0PJX0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CIB4A0PJX0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CIB4A0PJX0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CIB4A0PJX0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIB4A0PJX0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIB4A0PJX0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIB4A0PJX0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CIB4A0PJX0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CIB4A0PJX0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CIB4A0PJX0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CIB4A0PJX0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CIB4A0PJX0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIB4A0PJX0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIB4A0PJX0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIB4A0PJX0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIB4A0PJX0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CIB4A0PJX0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CIB4A0PJX0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CIB4A0PJX0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CIB4A0PJX0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CIB4A0PJX0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CIB4A0PJX0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CIB4A0PJX0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CIB4A0PJX0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CIB4A0PJX0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CIB4A0PJX0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CIB4A0PJX0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CIB4A0PJX0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CIB4A0PJX0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CIB4A0PJX0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CIB4A0PJX0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CIB4A0PJX0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms