Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J272

TRAV24, T-cell receptor alpha variable 24 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV24A0A0B4J272 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAV24A0A0B4J272 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAV24A0A0B4J272 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAV24A0A0B4J272 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAV24A0A0B4J272 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAV24A0A0B4J272 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAV24A0A0B4J272 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAV24A0A0B4J272 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAV24A0A0B4J272 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAV24A0A0B4J272 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAV24A0A0B4J272 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAV24A0A0B4J272 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAV24A0A0B4J272 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAV24A0A0B4J272 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAV24A0A0B4J272 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAV24A0A0B4J272 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAV24A0A0B4J272 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAV24A0A0B4J272 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAV24A0A0B4J272 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAV24A0A0B4J272 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAV24A0A0B4J272 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAV24A0A0B4J272 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAV24A0A0B4J272 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAV24A0A0B4J272 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAV24A0A0B4J272 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAV24A0A0B4J272 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAV24A0A0B4J272 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAV24A0A0B4J272 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAV24A0A0B4J272 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAV24A0A0B4J272 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAV24A0A0B4J272 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAV24A0A0B4J272 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAV24A0A0B4J272 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAV24A0A0B4J272 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAV24A0A0B4J272 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAV24A0A0B4J272 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAV24A0A0B4J272 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAV24A0A0B4J272 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAV24A0A0B4J272 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAV24A0A0B4J272 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAV24A0A0B4J272 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAV24A0A0B4J272 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAV24A0A0B4J272 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAV24A0A0B4J272 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAV24A0A0B4J272 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAV24A0A0B4J272 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAV24A0A0B4J272 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAV24A0A0B4J272 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAV24A0A0B4J272 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAV24A0A0B4J272 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAV24A0A0B4J272 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAV24A0A0B4J272 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAV24A0A0B4J272 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAV24A0A0B4J272 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAV24A0A0B4J272 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAV24A0A0B4J272 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAV24A0A0B4J272 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAV24A0A0B4J272 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAV24A0A0B4J272 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAV24A0A0B4J272 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAV24A0A0B4J272 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAV24A0A0B4J272 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAV24A0A0B4J272 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAV24A0A0B4J272 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAV24A0A0B4J272 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAV24A0A0B4J272 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAV24A0A0B4J272 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAV24A0A0B4J272 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAV24A0A0B4J272 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAV24A0A0B4J272 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAV24A0A0B4J272 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAV24A0A0B4J272 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAV24A0A0B4J272 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAV24A0A0B4J272 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAV24A0A0B4J272 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAV24A0A0B4J272 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAV24A0A0B4J272 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAV24A0A0B4J272 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAV24A0A0B4J272 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAV24A0A0B4J272 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAV24A0A0B4J272 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAV24A0A0B4J272 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAV24A0A0B4J272 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAV24A0A0B4J272 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAV24A0A0B4J272 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAV24A0A0B4J272 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAV24A0A0B4J272 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAV24A0A0B4J272 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAV24A0A0B4J272 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAV24A0A0B4J272 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAV24A0A0B4J272 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAV24A0A0B4J272 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAV24A0A0B4J272 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAV24A0A0B4J272 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAV24A0A0B4J272 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAV24A0A0B4J272 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAV24A0A0B4J272 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAV24A0A0B4J272 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAV24A0A0B4J272 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAV24A0A0B4J272 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms