Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WSZ9

TRAV30, T-cell receptor alpha variable 30 (Fragment), humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV30A0A087WSZ9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAV30A0A087WSZ9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAV30A0A087WSZ9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAV30A0A087WSZ9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAV30A0A087WSZ9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAV30A0A087WSZ9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAV30A0A087WSZ9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAV30A0A087WSZ9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAV30A0A087WSZ9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAV30A0A087WSZ9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAV30A0A087WSZ9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAV30A0A087WSZ9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAV30A0A087WSZ9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAV30A0A087WSZ9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAV30A0A087WSZ9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAV30A0A087WSZ9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAV30A0A087WSZ9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAV30A0A087WSZ9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAV30A0A087WSZ9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAV30A0A087WSZ9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAV30A0A087WSZ9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAV30A0A087WSZ9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAV30A0A087WSZ9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAV30A0A087WSZ9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAV30A0A087WSZ9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAV30A0A087WSZ9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAV30A0A087WSZ9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAV30A0A087WSZ9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAV30A0A087WSZ9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAV30A0A087WSZ9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAV30A0A087WSZ9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAV30A0A087WSZ9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAV30A0A087WSZ9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAV30A0A087WSZ9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAV30A0A087WSZ9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAV30A0A087WSZ9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAV30A0A087WSZ9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAV30A0A087WSZ9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAV30A0A087WSZ9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAV30A0A087WSZ9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAV30A0A087WSZ9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAV30A0A087WSZ9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAV30A0A087WSZ9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAV30A0A087WSZ9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAV30A0A087WSZ9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAV30A0A087WSZ9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAV30A0A087WSZ9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAV30A0A087WSZ9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAV30A0A087WSZ9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAV30A0A087WSZ9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAV30A0A087WSZ9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAV30A0A087WSZ9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAV30A0A087WSZ9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAV30A0A087WSZ9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAV30A0A087WSZ9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAV30A0A087WSZ9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAV30A0A087WSZ9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAV30A0A087WSZ9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAV30A0A087WSZ9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAV30A0A087WSZ9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAV30A0A087WSZ9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAV30A0A087WSZ9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAV30A0A087WSZ9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAV30A0A087WSZ9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAV30A0A087WSZ9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAV30A0A087WSZ9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAV30A0A087WSZ9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAV30A0A087WSZ9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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TRAV30A0A087WSZ9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAV30A0A087WSZ9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAV30A0A087WSZ9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAV30A0A087WSZ9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAV30A0A087WSZ9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAV30A0A087WSZ9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAV30A0A087WSZ9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAV30A0A087WSZ9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAV30A0A087WSZ9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAV30A0A087WSZ9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAV30A0A087WSZ9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAV30A0A087WSZ9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAV30A0A087WSZ9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAV30A0A087WSZ9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAV30A0A087WSZ9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAV30A0A087WSZ9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAV30A0A087WSZ9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAV30A0A087WSZ9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAV30A0A087WSZ9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRAV30A0A087WSZ9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRAV30A0A087WSZ9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRAV30A0A087WSZ9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRAV30A0A087WSZ9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAV30A0A087WSZ9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAV30A0A087WSZ9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAV30A0A087WSZ9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAV30A0A087WSZ9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAV30A0A087WSZ9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAV30A0A087WSZ9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAV30A0A087WSZ9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAV30A0A087WSZ9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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