Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAF6Q9Y4K3 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAF6Q9Y4K3 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAF6Q9Y4K3 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAF6Q9Y4K3 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAF6Q9Y4K3 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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TRAF6Q9Y4K3 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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TRAF6Q9Y4K3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAF6Q9Y4K3 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAF6Q9Y4K3 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAF6Q9Y4K3 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAF6Q9Y4K3 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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TRAF6Q9Y4K3 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAF6Q9Y4K3 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAF6Q9Y4K3 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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TRAF6Q9Y4K3 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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TRAF6Q9Y4K3 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TRAF6Q9Y4K3 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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