Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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GTF3C6Q969F1 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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GTF3C6Q969F1 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
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GTF3C6Q969F1 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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GTF3C6Q969F1 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3C6Q969F1 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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