Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 PARVA-201ENST00000334956 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 GOLGA6L4-203ENST00000510439 4563 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 VDR-202ENST00000395324 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 SEMA6D-201ENST00000316364 6099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 NWD1-206ENST00000552788 6964 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 SPIN3-201ENST00000374919 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 MROH7-TTC4-201ENST00000414150 5867 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RRN3P1Q2M238 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms