Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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