Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBASH3AP57075 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms