Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GGCXP38435 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GGCXP38435 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GGCXP38435 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GGCXP38435 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GGCXP38435 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GGCXP38435 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GGCXP38435 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GGCXP38435 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GGCXP38435 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GGCXP38435 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GGCXP38435 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GGCXP38435 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GGCXP38435 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GGCXP38435 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GGCXP38435 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GGCXP38435 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GGCXP38435 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GGCXP38435 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GGCXP38435 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GGCXP38435 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GGCXP38435 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GGCXP38435 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GGCXP38435 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GGCXP38435 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GGCXP38435 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GGCXP38435 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms