Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
XBP1P17861 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
XBP1P17861 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XBP1P17861 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XBP1P17861 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XBP1P17861 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XBP1P17861 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XBP1P17861 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XBP1P17861 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XBP1P17861 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XBP1P17861 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
XBP1P17861 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XBP1P17861 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XBP1P17861 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
XBP1P17861 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms