Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL5P13501 AC116552.1-201ENST00000563243 733 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL5P13501 AL592146.2-201ENST00000565388 444 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL5P13501 IGHV1OR16-3-201ENST00000568138 205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL5P13501 AC100778.4-201ENST00000581232 582 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL5P13501 FAM223B-202ENST00000598177 713 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL5P13501 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL5P13501 Metazoa_SRP.47-201ENST00000616942 279 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL5P13501 AC117500.5-201ENST00000623233 527 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL5P13501 FAM223A-202ENST00000625204 713 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL5P13501 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL5P13501 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL5P13501 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL5P13501 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL5P13501 AC005519.2-201ENST00000554532 1367 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL5P13501 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL5P13501 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL5P13501 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL5P13501 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL5P13501 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL5P13501 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL5P13501 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL5P13501 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL5P13501 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL5P13501 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL5P13501 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL5P13501 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL5P13501 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL5P13501 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL5P13501 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL5P13501 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL5P13501 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL5P13501 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL5P13501 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 S100A6-202ENST00000368720 673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 CA6-201ENST00000377436 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 CA6-202ENST00000377442 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 POLR3DP1-201ENST00000398689 1176 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 CLK2P1-201ENST00000416636 1294 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 AP000343.1-201ENST00000440602 385 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 RPL21P135-201ENST00000442539 791 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 AP002852.2-202ENST00000523572 592 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 AC063924.1-201ENST00000546680 673 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 GABARAPL2-203ENST00000565057 571 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 AC116914.2-201ENST00000571741 291 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 AC092296.1-201ENST00000587018 566 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 AL645940.1-201ENST00000606432 594 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 Metazoa_SRP.64-201ENST00000611904 268 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 AL139220.2-222ENST00000627999 756 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL5P13501 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL5P13501 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL5P13501 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL5P13501 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL5P13501 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL5P13501 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL5P13501 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL5P13501 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL5P13501 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL5P13501 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL5P13501 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL5P13501 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL5P13501 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms