Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC192P0DO97 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms