Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SLC3A1-205ENST00000409387 2334 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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