Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AC140125.3-202ENST00000504362 348 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AC138965.1-201ENST00000509329 348 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C4orf17Q53FE4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms