Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CCDC142Q17RM4 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CCDC142Q17RM4 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CCDC142Q17RM4 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CCDC142Q17RM4 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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CCDC142Q17RM4 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CCDC142Q17RM4 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CCDC142Q17RM4 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCDC142Q17RM4 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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