Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 ANKRA2-201ENST00000296785 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC006144.1-201ENST00000424220 1600 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 VANGL1-201ENST00000310260 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 FSTL1-202ENST00000424703 1396 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 LINC01134-202ENST00000439488 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 BBOF1-201ENST00000394009 3106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 ACOXL-202ENST00000389811 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 THUMPD3-206ENST00000452837 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 LOXHD1-204ENST00000398705 1824 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 GLYR1-212ENST00000591451 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 PLK4-210ENST00000514379 3060 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 RGL1-202ENST00000360851 4724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 ZNF44-202ENST00000355684 2119 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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CTF1Q16619 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC002550.1-201ENST00000565916 1379 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 CASP7-201ENST00000345633 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 XAB2-201ENST00000358368 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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