Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFNP31947 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFNP31947 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFNP31947 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFNP31947 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFNP31947 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFNP31947 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFNP31947 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFNP31947 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFNP31947 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFNP31947 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFNP31947 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFNP31947 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFNP31947 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFNP31947 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFNP31947 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFNP31947 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFNP31947 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms