Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VIL1P09327 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VIL1P09327 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VIL1P09327 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VIL1P09327 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VIL1P09327 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VIL1P09327 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms