Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PLD3Q8IV08 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms