Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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