Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms