Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP8P40818 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
USP8P40818 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
USP8P40818 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms