Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CHFR-201ENST00000266880 11133 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 RIOK3-201ENST00000339486 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 HDLBP-203ENST00000391975 6372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 LDLRAD3-201ENST00000315571 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SLC13A2-202ENST00000444914 2855 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 IVD-203ENST00000479013 4251 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ATP8B2-202ENST00000368489 5861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 KCNH1-209ENST00000639952 8075 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 UGGT2-203ENST00000376747 4832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SLC44A1-201ENST00000374720 10511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PRKAG3-203ENST00000439262 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 NWD1-206ENST00000552788 6964 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 DYNC1I1-204ENST00000437599 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SLC26A2-201ENST00000286298 8080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 RGS8-201ENST00000258302 5606 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 MIEF1-201ENST00000325301 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AP3S2-201ENST00000336418 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 LAMB1-203ENST00000393560 2806 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PLEKHA2-209ENST00000617275 5582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SCN5A-209ENST00000451551 8343 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AL590428.1-201ENST00000428865 1973 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 GCC2-201ENST00000309863 7537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 NR1I2-202ENST00000393716 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 APC2-203ENST00000535453 11656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ROBO4-208ENST00000533054 3071 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 RPS6KA1-220ENST00000531382 2359 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 EIF3C-209ENST00000566501 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 C1GALT1-205ENST00000436587 6235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 TRPC4-206ENST00000379705 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms