Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
VPREB1P12018 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 FAM131B-202ENST00000409346 4295 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 TECPR2-201ENST00000359520 8686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
VPREB1P12018 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms