Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CREB3O43889 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CREB3O43889 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CREB3O43889 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CREB3O43889 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CREB3O43889 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CREB3O43889 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CREB3O43889 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREB3O43889 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREB3O43889 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREB3O43889 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREB3O43889 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREB3O43889 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREB3O43889 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREB3O43889 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREB3O43889 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREB3O43889 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREB3O43889 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREB3O43889 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREB3O43889 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREB3O43889 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREB3O43889 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREB3O43889 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREB3O43889 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREB3O43889 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREB3O43889 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREB3O43889 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREB3O43889 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREB3O43889 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREB3O43889 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CREB3O43889 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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