Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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