Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1GALT1-205ENST00000436587 6235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RALA-201ENST00000005257 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS10P7-201ENST00000441932 2329 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP1M1-203ENST00000444449 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOCS2-AS1-201ENST00000499137 3325 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TREH-201ENST00000264029 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATIC-201ENST00000236959 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OACYLP-201ENST00000417918 2208 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CANX-209ENST00000504734 2232 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC37A2-201ENST00000308074 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NT5C3AP1-202ENST00000441170 1663 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC16A7-203ENST00000547379 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHB15-201ENST00000231173 4017 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTAGE7P-201ENST00000435712 2436 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VAV1-207ENST00000599806 2717 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D29-202ENST00000580161 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGLEC11-203ENST00000447370 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENDOU-201ENST00000229003 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCT8-201ENST00000286788 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBLN2-201ENST00000295760 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNH6-201ENST00000314672 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAND5-201ENST00000317060 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPN1-208ENST00000527323 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HERC2P9-206ENST00000529624 5187 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LILRB3-203ENST00000391750 2848 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC44A4-203ENST00000375562 2505 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA1-202ENST00000373555 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MATR3-233ENST00000504203 2243 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALT-201ENST00000378842 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INAVA-201ENST00000367342 4298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM131B-202ENST00000409346 4295 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HK2P1-201ENST00000447818 2737 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL12A-AS1-203ENST00000497452 2425 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSL6-207ENST00000379264 6539 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTERF2-207ENST00000552029 3235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GREM2-201ENST00000318160 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPC1L1-204ENST00000546276 4826 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIGAR-204ENST00000635110 3633 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPF-202ENST00000356053 2670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPF-207ENST00000544000 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AIF1L-206ENST00000372302 3340 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PXN-204ENST00000424649 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AREL1-201ENST00000356357 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00540-203ENST00000631321 2412 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHOX-203ENST00000381578 3757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOCS6-201ENST00000397942 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHMT2-205ENST00000553474 1765 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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