Protein–RNA interactions for Protein: D3W0D1

KLRF2, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF2D3W0D1 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLRF2D3W0D1 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms