Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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