Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms