Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms