Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HS2ST1Q7LGA3 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms